1. Lãnh đạo NAFIQPM2 có Giám đốc và các Phó Giám đốc theo quy định của pháp luật.

Giám đốc điều hành hoạt động của Trung tâm, chịu trách nhiệm trước Cục trưởng Cục Chất lượng, Chế biến và Phát triển thị trường và trước pháp luật về mọi hoạt động của Trung tâm; ban hành Quy chế làm việc và điều hành hoạt động của Trung tâm; quản lý, sử dụng viên chức và người lao động của Trung tâm theo vị trí việc làm và quy định của pháp luật.

Phó Giám đốc giúp Giám đốc theo dõi, chỉ đạo, thực hiện một số lĩnh vực công tác theo phân công của Giám đốc và chịu trách nhiệm trước Giám đốc và trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công.

2. Cơ cấu tổ chức:

• Phòng Hành chính, Tổng hợp;
• Phòng Chất lượng, An toàn thực phẩm;
• Phòng Phát triển thị trường;
• Phòng Kiểm nghiệm hóa học;
• Phòng Kiểm nghiệm sinh học.

(theo Quyết định số 1082/QĐ-BNNMT ngày 24/4/2025 của Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Môi trường)